Miksi useimmat restriktioentsyymit leikkaavat palindromisessa sekvenssissä?

Miksi useimmat restriktioentsyymit leikkaavat palindromisessa sekvenssissä?
Anonim

Vastaus:

Koska se on tehokkaampaa.

Selitys:

Entsyymien, kuten restriktioentsyymien, täytyy tunnistaa hyvin spesifinen sekvenssi tehtävänsä suorittamiseksi. Se sitoutuu DNA: han vain yhdessä spesifisessä konfiguraatiossa. Onneksi! koska et halua "pacmania", joka leikkaa DNA: ta satunnaisissa paikoissa.

DNA on kaksisäikeinen, joten sillä on "kaksi puolta", joihin entsyymi voi sitoutua. Palindrominen sekvenssi on sama molemmilla puolilla taaksepäin ja eteenpäin (katso kuva alla). Tämä tarkoittaa, että entsyymi tunnistaa sekvenssin riippumatta siitä, millä puolella entsyymi lähestyy DNA: ta.

Palindrominen sekvenssi lisää myös mahdollisuutta, että molemmat DNA-säikeet leikataan. On jopa mahdollista, että kaksi entsyymiä toimii dimeerinä palindromisen sekvenssin leikkaamiseksi edelleen tehokkuuden lisäämiseksi.

Viimeinen syy on ollut tärkeä virusten ja bakteerien välisessä taistelussa. Bakteerit ovat kehittyneet "poistamaan" bakteerikohtaisia viruksia (bakteriofageja) käyttämällä restriktioentsyymejä, jotka sitoutuvat näihin palindromisiin sekvensseihin. Molempien DNA-säikeiden leikkaaminen vahingoittaa virusta enemmän kuin yhden juosteen leikkaaminen.