Mikä voisi olla ongelma, jos bändejä ei näy Western Blotissa?

Mikä voisi olla ongelma, jos bändejä ei näy Western Blotissa?
Anonim

Vastaus:

Monet …

Selitys:

On monia syitä, miksi bändit eivät välttämättä näy länsimaassa. Onko näytteen ja vasta-aineiden yhdistelmät toimineet aiemmin?

Alla on vain muutamia, joita voin ajatella tällä hetkellä, jolloin taajuusalueet eivät näy:

  1. Onko proteiini siirtynyt geelistä? Kokeile värjäämällä kalvo sellaisella ponceau S: llä tai amido-mustalla, että näet, ovatko nauhat läsnä. Joskus voit nähdä kalvon proteiinikaistat kostuttamalla ja pitämällä sitä kulmassa valoa vasten.

  2. Onko ensisijainen vasta-aine toimiva? Tämä on kova testi ja ainoa tapa, jolla voit olla, on sisällyttää positiivinen valvonta, jossa tiedät, että sinulla on kiinnostava proteiini. Jos sinulla on mielenkiintoista proteiinia, voit yrittää tarkistaa sen Western blotting -kalvolle (ts. Et juokse geeliä) ja nähdä, jos saat tuloksen, jos käsittelet kalvoa kuin se olisi länsimaista.

  3. Onko sekundäärinen vasta-aine tunnistaa primaarisen vasta-aineen? Jälleen on vaikea testata. Tietoja ainoasta testistä, jonka voit tehdä, on edellä kohdassa 2 mainittu pistetesti.

  4. Onko "havaitsemisjärjestelmä"? Riippuen käytettävästä havaitsemismenetelmästä voit kokeilla joitakin sekundaarisia vasta-aineita, jotta havaitaan, onko havaitsemisliuos ja myös sekundaarisen vasta-aineen liipaiseva aine / entsyymi toimivat. Eli voitko käynnistää reaktion vain toissijaisen vasta-aineen kanssa?

Lopuksi, se voisi olla yhtä yksinkertainen kuin yksi ratkaisu, jota käytettiin väärin tehdyn tontin koetuksessa. Jos esimerkiksi suolapitoisuus on väärässä puskurissa, tämä voi aiheuttaa vasta-aineiden vapautumisen blotista. Sama pätee myös, jos puskurien pH olisi virheellinen.

"Weirdest" syy siihen, että läntinen blot ei toimi, jota olen henkilökohtaisesti kokenut, oli se, kun muutimme maitojauheen toimittajan, jota käytimme kalvon estämiseen. Uuden toimittajan jauhe sisälsi fosfotyrosiinifosfataasin, joka poistti kaikki fosfaatti- ryhmät, joita yritimme havaita fosfotyrosiinivasta-aineemme kanssa.